+ /     

Биологический факультет БГУ - Кафедра генетики.    

Сотрудники кафедры




Гринев Василий Викторович


Кандидат биологических наук, доцент.








Краткая биография | Педагогическая работа | Дипломные проекты | Научная работа | Публикации | Контактная информация

Научно-исследовательская работа Гринева В. В. сосредоточена на выяснении особенностей организации и функционирования транскриптомов нормальных и раковых клеток человека гемопоэтического происхождения. Особое внимание Гринев В. В. уделяет изучению эффекта таких гибридных онкогенов, как RUNX1-RUNX1T1 и KMT2A-AFF1 на структурно-функциональную организацию транскриптомов клеток острых лейкозов в сравнении с нормальными гемопоэтическими клетками человека. Кроме этих вопросов Гринев В. В. интересуется проблемами локальной и глобальной комбинаторики экзонов во время сплайсинга РНК, цис- и транс-детерминантами этого процесса, молекулярными механизмами формирования «образов» полноразмерных РНК, а также механизмами устойчивого функционирования всей системы сплайсинга РНК в клетках человека.
Для выяснения выше перечисленных вопросов используются первичные данные, которые генерируются в лаборатории молекулярной генетики человека при кафедре генетики биологического факультета БГУ, OMICS-данные (микроэррей, DNA-Seq, RNA-Seq и ChIP-Seq), получаемые в лабораториях, с которыми сотрудничает Гринев В. В. (Лаборатория генетических биотехнологий Научного отдела Республиканского научно-практического центра детской онкологии, гематологии и иммунологии, д. Боровляны Минского района Минской области, Республика Беларусь; Genomics Research Laboratory, Department of Oncology, Luxembourg Institute of Health, Luxembourg; Paediatric Oncology & Haematology Group, Northern Institute for Cancer Research, Newcastle upon Tyne, UK), а также молекулярно-генетические данные, свободно доступные в различных базах данных (главным образом Ensembl, Gene Expression Omnibus, European Nucleotide Archive и Sequence Read Archive).


















Главные источники первичных данных, используемых в научно-исследовательской работе.

Первичные экспериментальные данные подвергаются комплексному биоинформационному анализу, основные этапы которого отражены на рисунке. Этот анализ базируется как на готовых аналитических решениях, собранных в базе Bioconductor, так и на оригинальных разработках Гринева В. В., созданных на языке программирования R. Ряд оригинальных программных разработок Гринева В. В. выложены в свободный доступ на Web-странице http://bio.bsu.by/genetics/grinev_software.html, или в репозитории GitHub по адресу https://github.com/VGrinev/transcriptome-analysis. Кроме того, обсуждение как общепринятых, так и оригинальных подходов в анализе транскриптомных данных приводится в блоге «Анализ транскриптома», который поддерживается и периодически обновляется Гриневым В. В.






















Ключевые аналитические подходы, используемые в научно-исследовательской работе.

Страница обновлена: 28.06.2018 12:46

Расписание 47 автобуса Расписание занятий Следуйте за белым кроликом...

 

Наверх Наверх Наверх 


На главную | © 2003-2019 Л. Валентович, П. Тумилович | Авторские права |