+ /     

Биологический факультет БГУ - Кафедра генетики.    

Сотрудники кафедры




Гринев Василий Викторович


Кандидат биологических наук, доцент.








Краткая биография | Педагогическая работа | Дипломные | Научная работа | Публикации | Разработки | Контактная информация

Научно-исследовательская работа Гринева В. В. сосредоточена на выяснении особенностей организации и функционирования транскриптомов лейкозных и нормальных клеток крови человека. Особое внимание Гринев В. В. уделяет изучению влияния инициаторов и драйверов лейкозогенеза (таких, как гибридные онкогены, а также гены, кодирующие факторы сплайсинга и эпигенетические регуляторы) на структурно-функциональную организацию транскриптомов лейкозных клеток в сравнении с нормальными клетками человека гемопоэтического происхождения. Кроме этих вопросов Гринев В. В. интересуется проблемами локальной и глобальной комбинаторики экзонов во время сплайсинга РНК, цис- и транс-детерминантами этого процесса, молекулярными механизмами формирования «образов» полноразмерных РНК, а также механизмами устойчивого функционирования всей системы сплайсинга РНК в клетках человека.
Для выяснения выше перечисленных вопросов используются первичные данные, которые генерируются в лаборатории молекулярной генетики человека при кафедре генетики биологического факультета БГУ, OMICS-данные (microarray, DNA-Seq, ATAC-Seq, ChIP-Seq, scaRNA-Seq, 4sUDRB-Seq, nascent RNA-Seq, total RNA-Seq и RIP-Seq), получаемые в лабораториях, с которыми сотрудничает Гринев В. В., а также молекулярно-генетические данные, свободно доступные в различных базах данных (главным образом Ensembl, TCGA, Gene Expression Omnibus, European Nucleotide Archive и Sequence Read Archive).


Главные источники первичных данных, используемых в научно-исследовательской работе.

Сотрудничество, результативность которого подтверждается совместными публикациями, Гриневым В. В. налажено с несколькими научно-исследовательскими учреждениями, находящимися как на территории Беларуси, так и за ее пределами:
1) кафедра генетики биологического факультета МГУ (г. Москва, Россия);
2) лаборатория биоинформационных методов комбинаторной химии и биологии, Институт биоорганической химии им. академиков Шемякина М. М. и Овчинникова Ю.А. Российской академии наук (г. Москва, Россия);
3) лаборатория биологии и генетики стволовых клеток ГУ «РНПЦ трансфузиологии и медицинских биотехнологий» (г. Минск, Республика Беларусь);
4) лаборатория генетических биотехнологий ГУ «РНПЦ детской онкологии, гематологии и иммунологии» (д. Боровляны Минского района Минской области, Республика Беларусь);
5) Biotech Research and Innovation Centre, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen (Copenhagen, Denmark);
6) Cell Biology Program and Center for Epigenetics, Memorial Sloan Kettering Cancer Center (New York, USA);
7) Institute of Cancer and Genomic Sciences, College of Medical and Dental Sciences, University of Birmingham (Birmingham, UK);
8) Multiomics Data Science Research Group, Department of Oncology, Luxembourg Institute of Health (Luxembourg, Luxembourg);
9) Princess Maxima Center for Pediatric Oncology (Utrecht, The Netherlands);
10) Wolfson Childhood Cancer Research Centre, Translational and Clinical Research Institute, Newcastle University (Newcastle, UK).
Кроме того, Гриневым В. В. поддерживаются активные творческие контакты с Dr. Elodie Laine (Analytical Genomics Team, Sorbonne Université, Paris, France), Prof. Martin Frith (Graduate School of Frontier Sciences, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, University of Tokyo, Japan), Dr. Paul Boutz (School of Medicine and Dentistry, University of Rochester Medical Center, University of Rochester, USA) и Dr. Sergei Grudinin (Inria Grenoble-Rhône-Alpes, Antenne Inria Giant, Grenoble Cedex, France).
Первичные экспериментальные данные подвергаются комплексному биоинформационному анализу, основные этапы которого отражены на рисунке. Этот анализ базируется как на готовых аналитических решениях, собранных в репозитории Bioconductor, так и на оригинальных разработках Гринева В. В. и его коллег, созданных на языках программирования R, C++ и Java. Ряд оригинальных программных разработок Гринева В. В. выложены в свободный доступ на Web-странице http://bio.bsu.by/genetics/grinev_software.html, или в репозитории GitHub по адресу https://github.com/VGrinev. Кроме того, обсуждение как общепринятых, так и оригинальных подходов в анализе транскриптомных данных приводится в блоге «Анализ транскриптома», который поддерживается и периодически обновляется Гриневым В. В.


Ключевые аналитические подходы, используемые в научно-исследовательской работе.

Страница обновлена: 07.04.2021 14:42

Расписание 47 автобуса Расписание занятий Следуйте за белым кроликом...

 

Наверх Наверх Наверх 


На главную | © 2003-2021 Л. Валентович, П. Тумилович | Авторские права |